花器官发育调控密码Fbox蛋白调控转录

撰文

GPQu花发育是被子植物生命周期中的一个重要发育过程。转录因子LEAFY(LFY)是花器官发育的主要调控因子,激活ABCE基因表达。F-Box蛋白UnusualFloralOrgans(UFO)是SKP1-Cullin1-F-box(SCF)E3泛素连接酶复合体的接头蛋白(adaptor)。LFY与UFO协同调控花器官发育,但其分子机制并不清楚。近日,来自法国的研究团队在NaturePlants在线发表了题为“TheF-boxproteinUFOcontrolsflowerdevelopmentbyredirectingthemastertranscriptionfactorLEAFYtonewcis-elements”的研究论文。该研究发现F-Box蛋白UFO与LFY形成转录复合体,调控LFYDNA结合特异性,识别新的DNA顺式作用元件,调控基因表达,进而影响花器官发育。UFO通过F-box结构域与SKP1互作,形成SCF泛素连接酶复合体,即F-box结构域对于UFO进行泛素化修饰必不可少。为了研究UFO是否通过泛素化修饰调控LFY下游基因表达,作者通过双荧光素酶报告实验和遗传实验,发现UFO与LFY对下游基因的调控不依赖于F-box结构域,即UFO不通过泛素化修饰调控LFY活性。进一步研究发现,LFY-UFO激活AP3转录的结合位点不同于经典的LFY结合位点。为了探究LFY-UFO基因组结合位点,作者通过ampDAP-seq(amplifiedDNAaffinitypurificationsequencing),发现多个UFO-LFY特异的结合位点,表明UFO和LFY形成复合体,识别新的DNA顺式作用元件,调控基因表达(图1)。图1LFY和UFO协同激活AP3表达此外,作者发现,LFYKR突变不影响LFY原本活性,但抑制UFO-LFY与下游靶基因的结合和转录调控活性,有助于未来区分LFY单独调控或LFY-UFO共同调控基因。通过冷冻电镜分析UFO-LFY-DNA结构,发现LFY-K位于UFO\LFY\DNA交界区域。从原子水平揭示了UFO调控LFYDNA结合活性的分子机制:UFO和LFY通过直接互作,共同参与识别DNA结合位点(图2)。图2复合体UFO-LFY-DNA原子结构为了研究LFY-UFO调控的保守性,作者检测了部分被子植物、裸子植物、蕨类植物和苔藓LFY同源蛋白与AtUFO蛋白互作,以及对AtAP3转录活性的调控,发现被子植物(矮牵牛、金鱼草)、裸子植物(百岁兰、银杏)和蕨类植物(美洲水蕨)LFY具有与AtLFY相似的活性,表明LFY-UFO复合体进化非常保守,在被子植物分化以前就存在。综上,F-box蛋白UFO直接与转录因子LFY形成复合体,调控LFYDNA结合特异性,调控基因表达,进而影响植物生长发育。不仅解析了UFO调控LFY活性的分子机制,而且,从全新的角度,揭示了UFO仅调控部分LFY靶基因的分子机制。论文链接:


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